Unele obiective NIKKOR Z includ un sistem multiplu de focalizare cu totul nou, format din două unități de acționare AF sincronizate cu precizie, pentru a obține focalizarea automată rapidă și corectă, a minimiza variația distanței focale în funcție de distanța de focalizare (focus breathing) în aplicațiile video și a permite captarea unor imagini de înaltă rezoluție, cu aberație minimă, chiar și în fotografiile close-up.
Un motor pas cu pas (STM) puternic și extrem de silențios asigură controlul rapid, sensibil și foarte precis al focalizării automate, contribuind în același timp la obținerea unor înalte performanțe optice.
Mecanica obținerii focalizării este optimizată pentru fiecare tip de obiectiv NIKKOR Z. La obiectivele cu sistem IF (Internal Focusing), doar grupul de lentile interne se deplasează, astfel încât obiectivul să își poată menține dimensiunea, permițând distanțe de focalizare mai mici. La obiectivele cu sistem RF (Rear Focusing), doar grupul de lentile posterior se deplasează pentru focalizare. Acest lucru face ca operația de focalizare automată să fie mai cursivă și mai rapidă.